정부는 이날 저녁 '김황식 국무총리 입장'이라는 긴급보도자료 배포를 통해 "절차상의 문제로 의도하지 않게 국민에게 심려를 드리게 된 점에 대해 송구스럽게 생각한다"고 사과했다. 김 총리는 "이 국익에 부합한 것이고 6월말까지 체결하기로 상대국과 협의했으며 상대국과 관련 절차가 완료되지 않은 상태 하에서 상호 공개하지 않는 것이 외교적 관례인 점을 감안한 것"이라고 해명했다
이에 앞서 이번 협상 창구인 외교통상부 조병제 대변인도 이날 오전 "19대 국회가 개원됨으로 국회와 협의한 후 협정 서명을 추진하기로 했다"고 밝혔다. 협정문은 이날 오후 서명할 예정이었으나 신각수 주일대사가 일본 외무성에 국내 사정을 이유로 서명이 어렵다는 입장을 전달한 것으로 알려졌다.
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