부처별로는 국방부가 259억9,000만원으로 가장 많고 해양경찰청 234억원, 교육부 107억원, 안전행정부 93억6,000만원, 해양수산부 70억원, 보건복지부 33억4,000만원 등이 뒤를 이었다. 경찰청(9억7,000만원), 법무부(6억7,000만원), 방위사업청(6억5,000만원), 소방방재청(5억2,000만원), 기상청(2억원), 문화재청(1억원), 여성가족부(7,000만원)도 사고 수습을 지원했다.
가장 많은 비용을 쓴 국방부는 야간 수색을 위한 조명탄과 함정·비행기 유류비, 해군 현장지원 장비·인력 등을 지원했다. 교육부는 단원고 학생 장례비용에 47억5,000만원, 생존자·유가족 심리치료에 36억8,000만원, 합동분향소 등 사고 수습 활동비에 12억9,000만원 등을 사용했다. 안행부는 진도에 48억5,000만원, 안산에 30억원, 인천에 5억원 등의 특별교부세를 지원했다. 해수부는 세월호 침몰사고 사망자 가족에게 세대당 85만3,400원의 생활안정비와 1인당 42만원의 구호비를 합해서 지원했고 생활비는 추가 지원할 예정이다. 하지만 실종자가 아직 10명 넘게 남아 있는데다 각종 대책을 정부가 추가로 추진할 방침인 만큼 사고 수습 비용은 더 늘어날 것으로 전망된다.
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